প্রচলিত মাদরাসা শিক্ষারও মূল লক্ষ্য ছিল ইহাই৷ কিন্তু মাদরাসা শিক্ষার বর্তমান ভাবধারায় শিক্ষিত সিংহভাগ লোকজন বিজ্ঞানের এই চরম উত্‍কর্ষের যুগে, ইসলাম ও বিজ্ঞানের সমন্বিত ব্যক্তি, সমাজ ও রাষ্ট গঠন এবং পরিচালনায় ব্যাপকভাবে অক্ষম বলিয়া প্রতিয়মান৷ এই কারণে প্রচলিত মাদরাসা শিক্ষা ব্যবস্থা খুবই উপেক্ষিত ও অবহেলিত৷ সংগত কারণেই ইসলামী শিক্ষার মূল উদ্দেশ্যকে শত ভাগ অক্ষুন্ন রাখিয়া আধুনিক জ্ঞান/বিজ্ঞান, প্রযুক্তি, পদ্ধতিকে প্রয়োজন অনুসারে ইসলামায়ণ ও সুন্দর সমন্বয় সাধনের মাধ্যমে, একটি আদর্শ ইসলামী শিক্ষা প্রতিষ্ঠান অত্যন্ত জরুরুী হইয়া পড়িয়াছে৷ যাহা পরবতর্ীতে অনুসরণীয় দৃষ্টান্ত হিসাবে আত্মপ্রকাশ করিবে৷ এ ছাড়া আমাদের দেশের মেধাবী ছাত্রদের ইসলামী উচ্চতর শিক্ষা অর্জনের জন্য আমাদের দেশে এখনও নির্ভরযোগ্য ইসলামী প্রতিষ্ঠানের যথেষ্ট অভাব রহিয়াছে৷ জামেয়া খাতামুন্নাবিয়্যীন (ইসলামী বিশ্ববিদ্যালয়) এরই একটি প্রয়াস মাত্র৷ আল্লাহ আমাদের এই ক্ষুদ্র প্রচেষ্টাকে কবুল করুন৷ আমীন৷